Björklövens Charles Beaudoin avgjorde när han sköt segermålet från backposition bakom en skymd Matthew Galajda efter 16.28 av förlängningen.
Galajda ersatte Carl Lindbom efter knappt halva matchen när Björklöven ledde med 1–0.
Djurgårdsbacken Calle Odelius fällde Björklövens framstormande back Veeti Vainio som åkte rakt in i Lindbom. Djurgårdsmålvakten föll till isen och vred sig i plågor.
Han reste sig, försökte men bröt sedan matchen.
– Det såg inte jättebra ut där och då, men förhoppningsvis är det inget allvarligt så hoppas han kommer tillbaka, säger forwarden Noah Östlund till C More.
Lindbom leder målvaktsligan i slutspelet och var tvåa i grundserien efter Björklövens Joona Voutilainen. En allvarlig skada på honom skulle försämra Djurgårdens chans på en snabb SHL-comeback.
Matthew Galajda släppte in 0–2-målet nästan direkt, men sedan reste sig både han och Djurgården.
Östlund reducerade och Liam Öhgren kvitterade i slutet av tredje perioden.
Inte heller Björklövenbacken Vainio kunde spela vidare efter kollisionen.
Nästa match i semifinalserien, som avgörs i bäst av sju matcher, spelas på tisdag i Umeå.