Det uppger federala åklagare enligt tyska medier.
Mannen, som arbetar för underrättelsetjänsten BND, greps på onsdagen. En husrannsakan har genomförts i hans bostad och kontor samt hos ytterligare en person, "som inte ingår i hans närmaste krets".
Mer detaljerad information om fallet vill BND inte lämna ut.
– Det är mycket viktigt med återhållsamhet och diskretion i det här specifika fallet. Det handlar om Ryssland, en aktör som vi måste räkna med agerar utan skrupler och är beredd att ta till våld, säger BND-chefen Bruno Kahl enligt FAZ.