– Jag vill säga det direkt till dig – du vet hur man ställer upp ambitiösa mål och du rör dig med självsäkerhet mot ett genomförande av dem, sade Putin via videolänk.
Anledningen till mötet var att ett ryskbyggt kärnkraftverk – landets första – invigdes i södra Turkiet på torsdagen.
Putin konstaterade bland annat att kärnkraftverket var "ett flaggskepp".
– Och ett övertygande exempel på hur mycket du, herr president Erdogan, gör för ditt land, för tillväxten av dess ekonomi, för alla turkiska medborgare.
Den ryske presidenten förklarade också att Ryssland var ett av de första länderna som skickade räddningsteam och medicinsk personal till Turkiet i efterdyningarna av februari månads förödande jordbävning.
– Vi är alltid redo att sträcka ut vänskapens hand till våra turkiska partner, sade Putin.
Erdogan, som visade sig offentligt första gången sedan han blev sjuk för två dagar sedan, såg bräcklig och skör ut, enligt nyhetsbyrån AFP.
I tisdags kväll tvingades den 69-årige presidenten, som styrt Turkiet under två decennier, avbryta en tv-intervju med hänvisning till magproblem.