Händelsen då 24 personer dödades, flera av dem studenter, anses ha bidragit till att militärjuntan föll och demokrati återinrättades.
Vanligtvis samlas tiotusentals för att hedra offren. Men tisdagens manifestation hade förbjudits av den konservativa regeringen ledd av premiärminister Kyriakos Mtsotakis på grund av coronapandemin.
Omkring 1 500 personer hade ändå samlats, många av dem anhängare till kommunistpartiet i landet.
Kravallutrustad polis avfyrade tårgas för att skingra demonstranter. En parlamentsledamot skadades i skärmytslingar och ett 100-tal personer greps.
Vänsterpartiet Syriza krävde att samtliga omhändertagna omedelbart skulle friges.