Minst 20 personer har omkommit.
I området längs gränsen mot Myanmar bor nästan en miljon rohingya-flyktingar i läger som sedan början av veckan har drabbats hårt av regn.
– Översvämningarna har strandsatt runt 306 000 människor i området Cox's Bazar. Minst 70 byar har översvämmats, säger Mamunur Rashid, av de administrativt ansvariga för området.
Runt 36 000 människor har förflyttats till skolor och härbärgen.
Omkring 740 000 människor tillhörande den muslimska minoriteten rohingya flydde 2017 från delstaten Rakhine i Myanmar, efter att landets armé inlett en massiv offensiv riktad mot folkgruppen. FN har kallat offensiven "ett skolboksexempel på etnisk rensning".