Eon vill att reservkraftvärmeverket ska få vara kvar i Inre hamnen, medan kommunen vill flytta verksamheten då Inre hamnen ska bebyggas med bostäder.
Kommunen har sagt upp tomträttsavtalet, något Eon överklagade.
Domen i mark- och miljödomstolen gav kommunen rätt. Nästa instans när Eon nu överklagar är mark- och miljööverdomstolen.
Eon menar att de båda samhällsnyttiga funktionerna, energiproduktion och byggandet av en stadsdel, borde kunna samexistera.
Enligt Björn Persson, regionchef vid Eon, finns det inget prejudikat, inget liknande rättsfall om att säga upp ett tomträttsavtal i ett sådant här sammanhang, varför Högsta Domstolen hypotetiskt i förlängningen skulle kunna ta upp ärendet, vilket ytterligare skulle förlänga tiden för ett slutligt beslut.
– Ibland jämställs ett tomträttsavtal nästintill som att det är ett eget ägande, säger Björn Persson.
På fredag ska Eon träffa Lars Stjernkvist (S), Kikki Liljeblad (S) och Inre hamnens projektledare Fredrik Wallin, för att diskutera den uppkomna situationen.