Endast om man använder appen i tjänsten, för redaktionellt innehåll eller i marknadsföringssyfte får man fortsätta använda den, skriver Deadline.
I de instruktioner som skickats ut meddelar bolaget att det även ser över om man helt ska förbjuda appen.
Tilltaget innebär en svängning i BBC:s inställning till tjänsten efter att det senaste året ha storsatsat på just Tiktok och anställt specialister i sitt sociala medieteam.
Agerandet kommer sedan den brittiska regeringen förbjudit användningen av Tiktok på både ministrars och tjänstemäns telefoner. De nya riktlinjerna följer också det danska public service-företaget DR som i förra veckan rådde sina anställda att sluta använda appen av säkerhetsskäl.
Även Sveriges Television och Sveriges Radio har tidigare uppmanat medarbetare att radera appen.