Rolf-Göran Bengtsson och Quintero La Silla rev ned två hinder och valde att avstå andrarundan.
Malin och "Tore" noterade ytterligare två nedslag och slutade alltså elva, vilket gav svenskan cirka 80 000 kronor i prispengar.
Hemmaryttaren Christian Ahlmann på Taloubet Z tog hand om världscuptiteln i den här sista omgången av världscupfinalen.
Malin Baryard-Johnsson var nöjd med sin häst och tävlingarna i Leipzig.
- Han är så fin, så fin. Nu kan han gå allt. Det är så himla stort där inne, när jag gick banan såg jag inte över ett enda hinder, säger Malin till ridsport.se